Chemical chaperones: mechanisms of action and potential use
2006, Handbook of experimental pharmacology
https://doi.org/10.1007/3-540-29717-0_16…
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Abstract
An increasing number of studies indicate that low-molecular-weight compounds can help correct conformational diseases by inhibiting the aggregation or enable the mutant proteins to escape the quality control systems, and thus their function can be rescued. The small molecules were named chemical chaperones and it is thought that they nonselectively stabilize the mutant proteins and facilitate their folding. Chemical chaperones are usually osmotically active, such as DMSO, glycerol, or deuterated water, but other compounds, such as 4-phenylbutiric acid, are also members of the chemical chaperone group. More recently, compounds such as receptor ligands or enzyme inhibitors, which selectively recognize the mutant proteins, were also found to rescue conformational mutants and were termed pharmacological chaperones. An increasing amount of evidence suggests that the action of pharmacological chaperones could be generalized to a large number of misfolded proteins, representing new therape...
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2018
Thèse présentée en vue de l'obtention du grade de Philosophiae Doctor (Ph.D) en Biologie Moléculaire option Biologie des Systèmes Avril 2017
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> Jusqu'à une époque récente le monde des arrestines n'était familier qu'à un nombre restreint de biologistes s'intéressant aux récepteurs à sept domaines transmembranaires (7TM) couplés aux protéines G hétérotrimériques. Comme leur nom l'indique, les arrestines sont des protéines dont la plus ancienne fonction connue est d'arrêter, en partenariat avec les G protein-coupled receptor kinases (GRK), des protéines kinases spécifiques des 7TM, le signal cellulaire propagé par cette famille de récepteurs via les protéines G. Cette fonction est essentielle car, pour être opérationnelle, toute régulation cellulaire par des récepteurs nécessite d'être limitée dans le temps. Ainsi, les arrestines visuelles des cônes et des bâtonnets interrompent l'activation de la transducine (la protéine G rétinienne) par la rhodopsine exposée à la lumière. Dans tous les autres tissus, les β-arrestines (βarr) 1 et 2 (βarr1 et βarr2) interagissent avec la plupart des autres 7TM en assurant le même type de régulation, connu sous le terme générique de désensibilisation. Un premier saut quantitatif dans l'élucidation des fonctions des βarrs remonte à environ huit ans quand il a été rapporté que ces molécules étaient également nécessaires au phénomène d'endocytose des 7TM activés par leurs ligands. Comme nous l'avons rappellé plus haut, la plupart des 7TM sont phosphorylés et désensibilisés après activation. La translocation des βarrs du cytosol vers les récepteurs acti-
médecine/sciences, 2002
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2011
Mon projet de recherche avait pour but de caractériser le rôle de deux protéines, ArgR et PepA, qui agissent en tant que facteurs accessoires de la recombinaison au niveau de deux sites cer du plasmide ColE1 présent dans la bactérie Escherichia coli. Ces deux protéines, couplées aux deux recombinases à tyrosine XerC et XerD, permettent la catalyse de la recombinaison site spécifique au niveau de la séquence cer, convertissant les multimères instables de ColE1 en monomères stables. Cette étude a principalement porté sur la région C-terminale de la protéine ArgR. Cette région de la protéine ArgR possède une séquence en acides-aminés et une structure similaire à celle de la protéine AhrC de Bacillus subtilis. De plus, AhrC, le répresseur de l'arginine de cette bactérie, est capable de complémenter des Escherichia coli mutantes déficientes en ArgR. Les régions C-terminales de ces protéines, montrent une forte similarité. De précédents travaux dans notre laboratoire ont démontré que des mutants d'ArgR comprenant des mutations dans cette région, en particulier les mutants ArgR149, une version tronquée d'ArgR de 149 acides-aminés, et ArgR5aa, une version comprenant une insertion de cinq acides-aminés dans la partie C-terminale, perdaient la capacité de permettre la recombinaison au niveau de deux sites cer présents dans le plasmide pCS210. Malgré cette incapacité à promouvoir la réaction de recombinaison en cer, ces deux mutants étaient toujours capables de se lier spécifiquement à l'ADN et de réprimer une fusion argA :: lacZ. Dans ce travail, les versions mutantes et sauvages d'ArgR furent surexprimées en tant que protéines de fusion 6-histidine. Des analyses crosslinking ont montré que la version sauvage et ArgR5aa pouvaient former des hexamères in-vitro de manière efficace, alors qu'ArgR149 formait des multimères de plus faible poids moléculaire. Des formes tronquées d'ArgR qui comportaient 150 acides-aminés ou plus, étaient encore capables de permettre la recombinaison en cer. Les mutants par substitution ArgRL149A et ArgRL151A ont tous montré que les substitutions d'un seul acide-aminé au sein de cette région avaient peu d'effets sur la recombinaison en cer. Les expériences de crosslinking protéine-à-protéine ont montré que le type sauvage et les formes mutantes d'ArgR étaient capables d'interagir avec la protéine accessoire PepA, également impliquée dans la recombinaison en cer. Les expériences de recombinaison in-vitro utilisant la forme V sauvage et les formes mutantes d'ArgR combinées avec les protéines PepA, XerC et XerD purifiées, ont montré que le mutant ArgR149 ne soutenait pas la recombinaison, mais que le mutant ArgR5aa permettait la formation d'une jonction d'Holliday. Des expériences de topologie ont montré que PepA était capable de protéger l'ADN de la topoisomérase 1, et d'empêcher ArgRWt de se lier à l'ADN. Les deux mutants ArgR149 et ArgR5aa protègent aussi l'ADN avec plus de surenroulements. Quand on ajoute PepA, les profils de migration montrent un problème de liaison des deux mutants avec PepA. D'autres expériences impliquant le triplet LEL (leucine-acide glutamique-leucine) et les acides-aminés alentour devraient être réalisés dans le but de connaitre l'existence d'un site de liaison potentiel pour PepA.

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