Papers by Eyyup Gulbandilar
Journal of Health Science, 2007
In this study, we describe and adapt the relevant methods of computed tomography (CT) and stereol... more In this study, we describe and adapt the relevant methods of computed tomography (CT) and stereology to estimate renal cell carcinoma (RCC) volume and volume ratio and compare the RCC volume estimations with the tumor stage. The study included 126 (82 men, 44 women) patients with RCC. The patients were evaluated by CT. The volume and volume ratio of the entire RCC was estimated by the following formula of Cavalierie's principles. According to TNM (tumor, nodes, metastasis) classification, there were 56 (44.4%), 30 (23.8%), and 40 (31.7%) cases in the stage T1, T2, T3, respectively. The results of the volume measurements which obtained from the Cavalier method were assessed according to the stages and were found as 125.52 ± 102.18 (25-394) cm 3 , as 346.25 ± 112.55 (181-545) cm 3 and 694.88 ± 405.46 (142-1546) cm 3 in stage T1, T2 and T3, respectively. The volume ratios between the stages were compared statistically and a significant difference were found between the stage T1 and stage T2, stage T2 and the stage T3 and stage T1 and stage T3, respectively. The average tumor volume ratios was found as 28.44% ± 14.37% (8.69%-61.26%), 55.42% ± 12.73% (25.78%-73.86%), and 72.48% ± 17.15% (48.80%-97.15%) in stage T1, T2 and T3, respectively. The present evaluation of RCC volume can be done on any complete set of CT images, where plane scan distance and magnification factor is known, which already take place on to CT images.
Osmangazi Üniversitesi Mühendislik-Mimarlık Fakültesi dergisi, Dec 21, 2022
Recent advances in machine learning, particularly with regard to deep learning, help to recognize... more Recent advances in machine learning, particularly with regard to deep learning, help to recognize and classify objects in medical images. In this study, endoscopy images were examined and deep learning method was used to classify healthy and polyp cells. For the proposed system, a database was created from the archives of General Surgery Department Endoscopy Unit in Kutahya Evliya Celebi Training and Research Hospital. The database contains 93 polyps and 216 normal images from 54 archive records. For image multiplexing, a total of 1236 images were obtained by rotating each image 90 degrees around its axis. K-fold Cross Validation method was used to reduce the variability of performance results. In this study, 48 different models were created by using different activation and optimization functions to find the best classification model in deep learning. According to the experimental results, it was observed that accuracy of the models depends on the selected parameters; the best model with the accuracy rate of 91% was obtained with 64 neurons in the hidden layer, ReLU activation function and RmsProp optimization method whereas the worst model with the accuracy rate of 76% was obtained with 32 neurons in the hidden layer, Tanh activation and RMSprop optimization functions. Accordingly, classification performance of polyp images can be optimized by utilizing different activation and optimization methods during the design of deep learning models.
Journal of Artificial Intelligence, Dec 15, 2018
Politeknik dergisi, Jan 29, 2018
Bu çalışmada, Reaktif Pudra Betonlarının (RPB) deneysel sonuçları incelenerek Uyarlamalı Sinirsel... more Bu çalışmada, Reaktif Pudra Betonlarının (RPB) deneysel sonuçları incelenerek Uyarlamalı Sinirsel Bulanık Çıkarım Sistemi (ANFIS) ile basınç dayanımını tahmin için bir modelin tasarımı araştırılmıştır. Bu modeli inşa etmek için 42 numunenin 7. ve 28. gün basınç dayanımları, ANFIS modelinin eğitim aşamaları için alınan deneylerden elde edilmiştir. Bu verilerden, hidratasyon günü, Portland Çimento (PÇ), silis dumanı, kuvars kumu, kum, su, süper akışkanlaştırıcı ve çelik lif olmak üzere 8 giriş parametresi ve betonun basınç dayanım çıkış parametresi olarak ANFIS modelinde kullanılmıştır. ANFIS modelinin 0,015 hata ile eğitim performansına sahip olduğu bulunmuştur. ANFIS test sonuçları ile deneysel sonuçlar karşılaştırıldığında, sırasıyla R 2 , RMS ve MAPE için 0,9909, 0,0277 ve 0,0004 istatistiksel olarak doğruluk olduğu gözlemlenmiş. Bu sonuçlar, ANFIS modelinin RPB'nin 7. ve 28. gün basınç dayanımlarının tahmini için yararlı bir model olduğunu göstermiştir.
Eskişehir Türk Dünyası uygulama ve araştırma merkezi Bilişim dergisi, Jan 31, 2023
Özet: Dijital çağ olarak nitelendirilen bu çağda, iletişim teknolojilerinin sunduğu hizmetler ile... more Özet: Dijital çağ olarak nitelendirilen bu çağda, iletişim teknolojilerinin sunduğu hizmetler ile dijital verilerin hem önemi hem de sayısı her geçen gün hızla artmaktadır. Karmaşık yapıdaki metinlerden anlamlı kelimeleri çıkarmak ve bilgiye ulaşmak için kullanılan en yaygın yöntemlerden birisi de Metin Madenciliği (MM) yöntemleridir. MM çalışmaları birçok alanda olduğu gibi tıp alanında da yaygın kullanılmaktadır. Bu çalışmanın amacı, İngilizce dilindeki bir tıp veri tabanı olan Pubmed platformu üzerinde bulunan ve cerrahi alan ile ilgili yayınlanmış makalelerden MM yöntemleri kullanılarak cerrahi alanındaki çalışmaların yönelimi hakkında fikir sahibi olmaktır. Aynı zamanda bu alanda yapılmış çalışmaların özetleri üzerinde MM kullanılarak anahtar kelimeler elde etmek ve bu kelimelerin frekans değerlerini görsel olarak sergilemektir. Çalışmanın veri setini oluşturan text dosyası üzerinde önce metin ön işleme daha sonra da metin analiz yöntemleri kullanılarak metin içerisinden yaygın olarak kullanılan beş adet anahtar kelime üretilmiştir. Üretilen anahtar kelimelerin frekans değerleri görselleştirilerek grafik ve kelime bulutu başarılı bir şeklinde ortaya konulmuştur.
Gazi university journal of science, Mar 20, 2023
Highlights • Molecular changes in the body in advanced diseases of the liver such as cirrhosis an... more Highlights • Molecular changes in the body in advanced diseases of the liver such as cirrhosis and HCC. • A consecutive approach for analysis of microarray data. • There is a significant change in the expression levels of 12 genes. • Gene expression levels accelerated after the formation of cirrhosis.
Politeknik dergisi, Sep 1, 2019
Kendiliğinden yerleşen betonun (KYB) son yıllarda beton teknolojisindeki en büyük gelişme olduğu ... more Kendiliğinden yerleşen betonun (KYB) son yıllarda beton teknolojisindeki en büyük gelişme olduğu söylenebilir. KYB'ler vibratör kullanılmaksızın çok sık donatılı ve karmaşık kesitli yapılarda yüksek dayanım vermektedir. KYB içeriğindeki; süper akışkanlaştırıcı kullanımı, viskozite artırıcı katkı kullanımı, su/bağlayıcı oranı, kum/toplam agrega oranı ve toplam iri agrega miktarı gibi özellikler açısından normal betondan farklıdır. Bu çalışma, KYB'lerde süper akışkanlaştırıcı katkıların oranıyla betondaki basınç dayanımının ve su/çimento oranındaki değişimleri, Uyarlamalı Sinirsel Bulanık Çıkarım Sistemleri (ANFIS) tahmin modeli ile araştırmak için tasarlanmıştır. Bu modeli inşa etmek için; çimento dozajı (300, 400 ve 450), KYB oranı ve çimento/su oranı giriş değişkeni olarak 28 günlük basınç dayanımı çıkış değişkeni seçilerek ANFIS modeli oluşturulmuştur. Tasarlanan modelin eğitiminde toplam 63 veri setinden rastgele olarak seçilen 53 adet veri kullanılmıştır. Eğitilen modelin test edilmesi içinde 10 adet veri seti kullanılmıştır. Test parametrelerinden elde edilen sonuçlar ile deneysel sonuçlar karşılaştırıldığında tasarlanan modelim 28 günlük basınç dayanımlarının tahmininde (R 2 =0,933, p<0,001, c=0,966) şeklinde başarılı sonuçlar ortaya koyduğu görülmüştür. Anahtar Kelimeler: Kendiliğinden yerleşen beton, basınç dayanımı, süper akışkanlaştırıcı, ANFIS.
Fatigue behaviors of different materials for schanz screws in femoral fracture model using finite element analysis
Optoelectronics and Advanced Materials-rapid Communications, 2014
In the daily life, human beings may be met with a number of undesired traumas. As a result, inter... more In the daily life, human beings may be met with a number of undesired traumas. As a result, intertrochanteric fractures can occur in the skeletal system. Intertrochanteric femoral fractures are serious traumas that can lead to pneumonia, pulmonary embolism or death. Therefore, fixing as accuracy and stabilty of these fractures is necessary. The schanz screws with pertrochanteric fixator body are used for stabilizaiton of intertrochanteric fractures. Fatigue behaviors of the schanz screws must be longer than the duration of fracture consolidation. The aim of this study is to determine whether there are differences between fatigue behaviours of different materials for schanz screws when they are used for intertrochanteric femoral fracture fixation. Fatigue behaviors of schanz screws used for fixing of intertrochanteric fractures were analysed with ANSYS Workbench software using finite element analysis under dynamic loads for stainless steel and titanium. After the analysis, minimum fatigue life has been determined as approximately 21 months for the schanz screws having stainless steel while titanium has been determined as approximately 2 months. In addition, safety factor for schanz screws having stainless steel is calculated as 1.36 whereas safety factor for titanium is calculated as 1. Therefore, considering the consolidation of an intertrochanteric femoral fracture with a mean duration of three months, the titanium schanz screws shouldn't be used since their fatigue behavior is two months and safety factor is less than stainless steel
Hayat Sigortalarında Bulanık Mantık Yöntemi ile Risk Değerleme Model
İşletme Araştırmaları Dergisi, 2014
Deciding insurability requires risk evaluation. The decision of insurability includes a complex s... more Deciding insurability requires risk evaluation. The decision of insurability includes a complex structure and requires assesment for risk factors. The purpose of study is providing a model that discusses many the risk factors in the life insurance and assessing risks and modelling risk. With this model, insurance companies make the right decision and determine the premium for the risk. The scope of the study consists of life insurance risks and modelling these risks with the method of fuzzy logic.
Eskişehir Türk Dünyası uygulama ve araştırma merkezi Bilişim dergisi, Jun 30, 2023
Özet: Bu çalışmada, pirinç kabuğu ikameli çimento hamurlarının priz süreleri uyarlamalı ağ tabanl... more Özet: Bu çalışmada, pirinç kabuğu ikameli çimento hamurlarının priz süreleri uyarlamalı ağ tabanlı bulanık çıkarım sistemi (ANFIS) ile tahmin edilmiştir. Çalışmanın ilk aşamasında, Portland çimentosu içerisine %0, %2.5, %5, %7.5, %10, %12.5 ve %15 oranlarında pirinç kabuğu külü ikame edilmiş olan çimento hamurlarının priz başlangıç ve priz sonu süreleri belirlenmiştir. İkinci aşamada, deneylerden elde edilen sonuçlarla gauss ve üçgen üyelik fonksiyonları kullanılarak iki model oluşturulmuş ve bu modeller yardımıyla priz başlangıç ve priz sonu süreleri tahmin edilmeye çalışılmıştır. Son aşamada ise modellerden elde edilen sonuçlarının güvenilirliği anlayabilmek için R 2 , MAPE ve RMSE olmak üzere üç farklı istatiksel yöntem kullanılmıştır. Elde edilen priz başlangıç sürelerine göre R 2 , MAPE ve RMSE değerleri sırasıyla; gauss üyelik fonksiyonları için 0.9912, 0.0167 ve 5.6537, üçgen üyelik fonksiyonları için ise 0.9957, 0.0119 ve 3.9661 olarak bulunmuştur. Priz sonu sürelerine göre ise R 2 , MAPE ve RMSE değerleri sırasıyla; gauss üyelik fonksiyonları için 0.9909, 0.0144 ve 5.8693, üçgen üyelik fonksiyonları için 0.9939, 0.0127 ve 4.8125 olarak tespit edilmiştir. İstatistiksel endeksler bir bütün olarak değerlendirildiğinde, priz başlangıç ve priz sonu süreleri açısından hem gauss hem de üçgen üyelik fonksiyonlarıyla oluşturulan modellerle gerçek değerlere çok yakın sonuçlar elde edildiği belirlenmiştir. Dolayısı ile her iki modelin de priz sürelerini tahmin etmek için güçlü modeller olduğu ifade edilebilir.
Eskişehir Türk Dünyası Uygulama ve Araştırma Merkezi Bilişim Dergisi
Son zamanlarda internet üzerinde üretilen veriler her geçen gün artmaktadır. Bu verilerin önemli ... more Son zamanlarda internet üzerinde üretilen veriler her geçen gün artmaktadır. Bu verilerin önemli bir çoğunluğunu da metinler oluşturmaktadır. Metinlerin çoğunlukta olması, bilim insanlarını bu alanda daha fazla çalışma yapmaya yönlendirmiştir. Metinler üzerinde yapılan çalışmaların en popüler olanı Konu Modelleme (KM) yöntemleridir. Konu modelleme yöntemleri metinlerin içerisinde gizli veya açık geçen konuları tespit etmektir. Bu çalışma kapsamında elde edilen metin veri kümeleri üzerinde Gizli Dirichlet Ayrımı (GDA), ilişkisel konu modeli (İKM) ve yapısal konu modeli (YKM) yöntemleri uygulanmıştır. Ayrıca çalışma da konu modelleme yöntemlerinin sonuçlarını karşılaştırabilmek için konu tutarlılığı ve çapraşıklık değerleri kullanılmıştır. Kaynak olarak kullanılan yayındaki yöntemlerin sonuçları ile çalışmada elde edilen sonuçların aynı olduğu görülmüştür. Çapraşıklık değerine ek olarak kullandığımız tutarlılık değeri de aynı şekilde YKM yönteminde daha başarılı sonuçlar elde edildiği gösterilmiştir. Tutarlılık değeri 0.509 olarak YKM tip 3 yöntemi en iyi sonucu vermiştir. Ayrıca bundan sonra yapılacak çalışmalar içinde karşılaştırma yöntemi gösterilmiştir.
Eskişehir Türk Dünyası uygulama ve araştırma merkezi Bilişim dergisi, May 18, 2022
Özet: Endüstriyel devrim ile gıda sanayinin ve insan vücudunun gerekli duyduğu enerjinin ana kayn... more Özet: Endüstriyel devrim ile gıda sanayinin ve insan vücudunun gerekli duyduğu enerjinin ana kaynağı ve tatlandırıcı ihtiyaçlarını karşılamak amacı ile şeker üretimi başlamıştır. Şeker üretimi doğal yollarla şeker pancarı ve şeker kamışı bitkilerinden karşılanmaktadır. Şeker üretmek için bitkilerin ekiminden sökümüne kadar birçok zararlıyla da mücadele edilmekte Şeker pancarı bitkisinin şeker üretimi yanında sağladığı bir sürü fayda vardır. Ülkemizde sıklıkla şeker pancarı ekimi gerçekleştirilmekte olup şeker üretiminde verimin kaybolmaması için birçok araştırma ve çalışma yapılmaktadır. Biz de bu çalışmamızda bu ana kaynaklardan biri olan şeker pancarı üretiminin de yapay zekâ kullanımına yönelik bir literatür taraması yaparak, bu konuda çalışma yapacak araştırmacılara farklı bir bakış açısı kazandırmayı hedefledik.
OSMANGAZİ JOURNAL OF MEDICINE, 2017
Human body have a complex structure. So, examine this structure require advanced level of enginee... more Human body have a complex structure. So, examine this structure require advanced level of engineering tools. In this study, temporale bones obtained from six different person were examined under the pressure of 5000 Pa. Stresses occurred on these bones under the applied pressure were determined using ANSYS Workbench finite element software. Total deformations were seen always on squamous part of the bones. This situation can be important for the clinical relevance of temporal trauma.
IC-P2-082: Evaluation of the size and area of the corpus callosum with Osiris method in Alzheimer's disease and correlation with patient characteristics
Alzheimer's & Dementia, 2008
Journal of Business Research - Turk, 2014
Sigorta edilebilirliğe karar vermek risk değerlemesini gerekli kılmaktadır. Sigorta edilebilirlik... more Sigorta edilebilirliğe karar vermek risk değerlemesini gerekli kılmaktadır. Sigorta edilebilirlik kararı karışık bir karar yapısını içermekte ve risk faktörlerine karşı değerlendirme gerektirmektedir. Çalışmanın amacı, hayat sigortalarında riski değerlendiren ve riski modelleyen birçok risk faktörünü ele alabilen bir model sunmaktır. Bu model ile sigorta şirketleri sigorta kararlarında doğru kararlar vererek riske göre prim belirleyebilecektir. Çalışmanın kapsamını hayat sigortaları riskleri ve bu risklerin bulanık mantık yöntemi ile modellenmesi oluşturmaktadır.
Eskişehir Türk Dünyası Uygulama ve Araştırma Merkezi Bilişim Dergisi, Jan 31, 2021
Son zamanlarda bilişim teknolojilerinin gelişmesiyle birlikte veri miktarı gün geçtikçe artmaktad... more Son zamanlarda bilişim teknolojilerinin gelişmesiyle birlikte veri miktarı gün geçtikçe artmaktadır. Bir verinin bilgiye dönüşmesi için verilerin analiz edilmesi, yorumlanması, işlenmesi ve bunlara bağlı olarak verilerden anlamlı bilgilere erişmek için kullanılan bir yöntem olan metin madenciliğinin önemi de artmaktadır. Metin madenciliği yönteminde, veri kaynağı olarak metinler ele alınmaktadır. Metin madenciliği, metinlerden istenilen bilgiye erişmek amacıyla kullanılmaktadır. Bu çalışmada, ilk olarak literatürde önemli bir yere sahip olan metin madenciliği yöntemi ile twitter üzerinden aşı (vaccine) ile ilgili iki farklı veri elde edilmiştir. Daha sonra ise verilerin duygu analizleri yapılmıştır. İlk veri seti covid19 aşısı 3. faz denemeleri esnasındaki elde edilen twitter verilerinden oluşmakta iken ikinci veri seti covid19 aşısının 3. faz denemeleri esnasında seri üretim duyurusu yapıldıktan sonra elde edilen twitter verilerinden oluşmaktadır. Bu verilere göre yapılan duygu analiz sonuçlarında önemli farklılıkların olduğu tespit edilmiştir.
Elektromanyetik alanın Saccharomyces cerevisiae maya hücrelerinin üremesi üzerine etkisinin spektrofotometrik olarak değerlendirilmesi
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 1999
Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi Dergisi, 2020
Dijital dönüşüm, sanayideki birçok sürecin veri odaklı yeni yaklaşımlarla ele alınmasını gerekli ... more Dijital dönüşüm, sanayideki birçok sürecin veri odaklı yeni yaklaşımlarla ele alınmasını gerekli kılmaktadır. Bu bağlamda Endüstri 4.0 ile beraber akıllı fabrikalarda önemli dijital dönüşüm çalışmaları gerçekleşmektedir. Akıllı fabrikalardaki dijital dönüşüme katkı sağlayacak en önemli teknolojilerden bir tanesi de otonom taşıyıcı araç (OTA)'lardır. OTA'ların fabrika içerisindeki görevlerini verimli bir şekilde gerçekleştirmeleri ve beklenmedik bir problem veya aksama olduğunda insan müdahalesi olmadan bu durumun veri üzerinden tespiti önemlidir. Bu çalışmada, OTA'ların fabrika içerisindeki trafik ağında oluşabilecek beklenmedik; durma, yavaşlama vb. kaynaklı anormal durumların tespiti için Bulanık mantık tabanlı anomali tespiti önerilmektedir. Yapılan testlerde önerilen yöntemin %71,87 başarıyla sonuç vermektedir.
Bu calismada, Saccharomyces cerevisiae maya hucrelerinin buyumesine 15 Hz’li pulslu elektromanye... more Bu calismada, Saccharomyces cerevisiae maya hucrelerinin buyumesine 15 Hz’li pulslu elektromanyetik alanin etkisi arastirilmistir. Istatistiksel incelemeler sonunda uyum (inkubasyon periyodunun ilk 6 saati) ve durgun (16-29 saatler arasi) doneminde deney ve kontrol gruplari arasinda anlamli fark bulunamamistir (P>0.05). Ekimden sonraki 6. saat ile 26. saat arasinda, manyetik alanin etkisinde buyuyen hucrelerin sayisinin kontrol grubunun hucre sayisindan daha dusuk oldugu ve sonuclarin istatistiksel olarak anlamli oldugu bulunmustur (P<0.001). Ayrica deney ve kontrol gruplarinin buyume egrileri matematiksel olarak incelenip, buyume denklemleri olusturulmustur. Istatistiksel incelemeler sonucunda, deneysel ve teorik buyume egrileri arasinda bir korelâsyonun oldugu bulunmustur (rC=0.998, rPEMF=0.99).
Analyzing Dna Sequence in Liver Diseases by Using Bioinformatic Computations
2019 4th International Conference on Computer Science and Engineering (UBMK), 2019
Liver cancer that appeared on cirrhosis level in our country, is among the top five most common c... more Liver cancer that appeared on cirrhosis level in our country, is among the top five most common cancer types in the world and also it is the third in the cancers causing death. In addition to being widely seen in society, because of its the most common type Hepatocellular Carcinoma (HCC) patients have very low survival probabilities except for organ transplant, importance of researches conducted to determination and analysis of molecular structures and protein interactions involved in the initiation and progression of HCC, has increased. In this study; differentially expressed genes and protein-protein interaction network were analyzed using microarray data obtained from 10 HCC patients' with 10 normal individuals' liver tissue samples and 17 HCC patients' with 20 cirrhosis patients' liver tissue samples. As a result of bioinformatics analysis done, meaningful changes at the level of expressions of the 12 genes which detected to play a key role in the initiation and progression of significant liver diseases. This situtation shows that it is becoming more difficult to fulfill the functions of the proteins encoded by these genes involved in processes such as cell division, proteolysis, nuclear division, DNA damage response and lipid metabolism regulation.
Uploads
Papers by Eyyup Gulbandilar