Papers by Guillaume Gigot
Quelles menaces pèsent sur la faune et la flore de France hexagonale et de Corse ? Un éclairage à partir de la Liste rouge nationale
Naturae, Apr 17, 2024
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), Mar 1, 2023
Centre d'expertise et de données sur le patrimoine naturel Dans une unité scientifique associant ... more Centre d'expertise et de données sur le patrimoine naturel Dans une unité scientifique associant des ingénieurs, des experts et des spécialistes de la donnée, PatriNat rapproche les compétences et les moyens de ses quatre tutelles que sont l'OFB, le MNHN, le CNRS et l'IRD. PatriNat coordonne des programmes nationaux d'acquisition de connaissance pour cartographier les écosystèmes, les espèces et les aires protégées, surveiller les tendances de la biodiversité terrestre et marine, répertorier les zones clefs pour la conservation de la nature (Znieff), et produire des référentiels scientifiques et techniques (TaxRef, HabRef, etc.). Ces programmes associent de nombreux partenaires et fédèrent les citoyens à travers des observatoires de sciences participatives (tels que Vigie-Nature, INPN espèces ou Vigie-terre). PatriNat développe des systèmes d'information permettant de standardiser, partager, découvrir, synthétiser et archiver les données aussi bien pour les politiques publiques (SIB, SINP) que pour la recherche (PNDB) en assurant le lien avec les systèmes internationaux (GBIF, CDDA, etc.) PatriNat apporte son expertise dans l'interprétation des données pour accompagner les acteurs et aider les décideurs à orienter leurs politiques : production d'indicateurs, notamment pour l'Observatoire national de la biodiversité (ONB) et des livrets de chiffres clés, élaboration des Listes rouges des espèces et écosystèmes menacés, revues systématiques, préparation des rapportages pour les directives européennes, élaboration d'outils de diagnostic de la biodiversité pour les acteurs des territoires, ou encore évaluation de l'efficacité des mesures de restauration. PatriNat organise également l'autorité scientifique CITES pour la France. L'ensemble des informations (de la donnée brute à la donnée de synthèse) est rendu publique dans les portails NatureFrance, INPN et Compteur BIOM.
Biodiversity and Conservation
Assessment methods have been developed to estimate a preliminary conservation status for species ... more Assessment methods have been developed to estimate a preliminary conservation status for species and subsequently to facilitate the building of Red Lists. Such pre-assessment methods could be particularly useful in the French Overseas Territories (FOTs) where Red Lists tend to be outdated or absent and where a high number of endemic species face detrimental anthropogenic pressures. We first aimed to conduct a preliminary assessment (hereafter, preassessment) of the conservation status of endemic plants from Guadeloupe, Martinique, Réunion, Mayotte, French sub-Antarctic islands, New Caledonia, and Scattered Islands. We then compared the various methods used in conducting the pre-assessment and discussed ways to adapt these methods to small territories. We compiled occurrence data of endemic species identified thanks to a previous taxonomic work and pre-assessed their conservation status under Red List criteria A and B and the use of a Random Forest algorithm. We then measured the accuracy, specificity, and sensitivity of each method based on existing Red Lists. The Random Forest algorithm and a method based on range-size performed best at correctly attributing conservation status. Using these pre-assessment methods, we estimated that up to 60% of the endemic flora of the FOTs is potentially threatened. Range restriction but also anthropogenic pressures were key factors that explained these risks. Pre-assessment methods are useful tools to get a first measure of species conservation status. These methods should be adapted to the territories considered and their conservation issues in order to reach a good performance.
Endangered Species Research, Aug 2, 2016
levels' by 2010 (UNEP 2014). This target was not met (Butchart et al. 2010), and ongoing changes ... more levels' by 2010 (UNEP 2014). This target was not met (Butchart et al. 2010), and ongoing changes in biodiversity and its dynamics are a growing concern for society (Pereira et al. 2010, Carvalheiro et al. 2013). As a consequence, the Parties of the CBD have agreed to a new strategic plan to prevent the extinction and improve the conservation status of threatened species by 2020 (CBD 2014). To achieve this objective, National Red Lists of Threatened Species (NRLTS) have been
Lankesteriana International Journal on Orchidology, Jun 17, 2015
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 2016
HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific re... more HAL is a multidisciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L'archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau recherche, publiés ou non, émanant des établissements d'enseignement et de recherche français ou étrangers, des laboratoires publics ou privés.
État De Conservation De La Biodiversité Forestière Métropolitaine : Peut-On Dire Que Ça Va Bien ?
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe), 2021
Sample_Locations
Geographic coordinates of the genetic sample
R script and data for the analysis of circuit-SDM model
The archive contains in the root: A file "README.TXT" to do the analysis. And several f... more The archive contains in the root: A file "README.TXT" to do the analysis. And several files either described in the README file or coresponding to data files: a file "insect.csv" coresponding to per stem abundance of B. fusca across subsaharan localities for the optimisation of the species distribution models. A file "Busseola_fusca.asc" corresponding to maxent projection at present. A file "a_values" corresponding to individual Fst/(1-Fst) values among the genetic samples. There are 4 directories: "Fit" contains de present worldclim data to fit the models. "Climatic_layers" contains the past and future climatic reconstrucitons. "maxent" contains the maxent projections. "cicuitscape" contains the circuitscape executables for cicuit resistance distance calculation
Ce travail correspond à un stage d'une durée de six mois-de Mars à Septembre 2002-qui complète la... more Ce travail correspond à un stage d'une durée de six mois-de Mars à Septembre 2002-qui complète la formation spécialisée en "Agronomie et Environnement" de l'Institut National Agronomique de Paris-Grignon (INA-PG). Il s'agit d'un stage de fin d'études pour l'obtention du Diplôme d'ingénieur délivré par l'INA-PG. La principale structure d'accueil fut le CIRAD de Montpellier (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement), au sein de l'équipe TERA (Territoires, Environnement et Acteurs) et plus précisément le programme ERE (Espaces et Ressources). Ce travail fut principalement co-encadré par Christophe Le Page, chargé de recherche au CIRAD-TERA, et par Raphaël Mathevet, chargé de recherche à la Station Biologique de la Tour du Valat. Organisme privé de recherche, la Tour du Valat a la forme juridique d'une fondation à but non lucratif, la Fondat ion Sansouire, reconnue d'utilité publique depuis 1978. La station est située au coeur de la Camargue, au sud de la ville d'Arles, et ses principaux axes d'activités concernent la recherche en écologie et la gestion des zones humides méditerranéennes. I. Introduction. a-La problématique de la gestion des zones humides. De la complexité d'une diversité d'acteurs et d'un multi-usage de ressources naturelles communes.
Botanical Journal of the Linnean Society, 2021
We present a phylogenetic analysis using plastid (matK, rbcL) and nuclear (nrITS) DNA for diverse... more We present a phylogenetic analysis using plastid (matK, rbcL) and nuclear (nrITS) DNA for diverse Euploca spp. (formerly Heliotropium section Orthostachys) from the worldwide distribution of a genus and including species encompassing the wide physiological and morphological diversity of the genus. Our results indicate that some remarkably complex features arose multiple times in parallel in Euploca, including attributes of its subsections under section Orthostachys, notably plants that, above ground, consist almost entirely of inflorescences. To elucidate in greater detail the distribution of C4 species in Euploca and Heliotropium s.s., we made > 800 δ 13C determinations, including some from the traditional genus Tournefortia. We greatly increase the number of proven C4 species in Euploca, but found none outside Euploca. Of the tested Euploca spp., c. 28% are C3 or intermediate in carbon fixation pathway. Our phylogenetic results indicate four parallel/convergent acquisitions of ...
Genetic_Data
Microsatellite dat
ETAT DES LIEUX DES ESPECES FAUNISTIQUES PRIORITAIRES POUR L'ACTION PUBLIQUE DANS LES DROM (Départements-régions d'outre-mer)
Les Plans nationaux d’action (PNA) sont des outils permettant d’agir pour la restauration d’un ét... more Les Plans nationaux d’action (PNA) sont des outils permettant d’agir pour la restauration d’un état de conservation favorable des espèces sauvages menacées. Jusqu’à présent, les Départements-régions d’outremer (Drom) ont peu bénéficié de cet outil. Or, la France a pris des engagements, notamment dans la Loi 2016-1087 qui vise à ce que les espèces endémiques les plus menacées de la Liste rouge nationale bénéficient d’un plan d’action opérationnel. Cette approche laisse de côté un grand nombre de groupes taxonomiques encore non évalués. La présente analyse fournit une hiérarchisation des espèces d’outre-mer selon les données disponibles et leurs statuts de conservation ou de patrimonialité, combinée à une consultation au niveau local. Elle a permis de proposer des listes d’espèces prioritaires pour l’action publique pour chacun des Drom. Autant que possible, sur la base d’une analyse multicritères, les espèces justifiant la mise en oeuvre d’un PNA font ici l’objet de regroupements pour lesquels une démarche diagnostic pourra être réalisée afin de sélectionner les PNA les plus pertinents et faisables. Ce document présente, sous forme de fiches doubles-pages par territoire, une synthèse des listes d’espèces faunistiques de référence utilisées dans la conservation de la biodiversité et des exercices de hiérarchisation menés localement, avec des recommandations pour l’analyse diagnostique (pré-requis à l’élaboration d’un PNA).
Botanical Journal of the Linnean Society, Jan 18, 2022
, within a few days of signing off on the page proofs for this paper. This publication was 20 yea... more , within a few days of signing off on the page proofs for this paper. This publication was 20 years in the making, and largely came to fruition through the perseverance, networking and insights of M. Frohlich. Heliotropium/Euploca was Mike's passion, and this work became his magnum opus. For the rest of us, his dedicated effort is now a cherished gift that can be shared far into the future.
La Liste Rouge Des Espèces Menacées en France Faune Vertébrée De Guyane
La Liste Rouge Des Espèces Menacées en France Faune Vertébrée De Guyane Poissons Deau Douce 2017
Résultats de la Liste rouge des Éphémères de France métropolitaine - Results of Ephemera (Mayflies) French Red List
ELABORATION D'UNE LISTE D'ESPECES MARINES A PROTEGER A MAYOTTE Diagnostic et propositions
La protection règlementaire des espèces (et de leurs habitats) émane de l’article L411-1 (et suiv... more La protection règlementaire des espèces (et de leurs habitats) émane de l’article L411-1 (et suivants) du Code de l’environnement. A Mayotte, département d’outre-mer, la biodiversité marine exceptionnelle bénéficie depuis 2010 d’un Parc naturel marin mais pas d’une protection juridique spécifique dédiée, si ce n’est via des arrêtés préfectoraux règlementant certaines activités comme la pêche ou le whale watching. La présente étude fait des recommandations en vue de l’élaboration d’une liste d’espèces marines protégées à Mayotte. L’inventaire des espèces indigènes recensées puis l’application de critères sélectifs ont mené à des pré-listes d’espèces à fort enjeu de conservation pour onze groupes taxonomiques. Ce premier diagnostic a ensuite été soumis à une série d’experts scientifiques (enquête en ligne) avant de consulter les acteurs locaux sur les usages et enjeux socioéconomiques du territoire. L’analyse et la synthèse des avis recueillis combinés à une revue bibliographique ont permis de proposer différents scénarios de protection. Finalement, les limites de cette étude, que ce soit le manque de données disponibles ou la difficulté d’appliquer le droit à Mayotte sont discutées, tout en proposant des pistes pour de futurs projets similaires.
Évaluation du Plan National d'Actions en faveur du Liparis de Loesel, 2010-2014 – Tome 1 : Évaluation et recommandations
Le Liparis de Loesel, orchidée emblématique des milieux humides, a vu ses populations décroitre c... more Le Liparis de Loesel, orchidée emblématique des milieux humides, a vu ses populations décroitre ces dernières décennies. Aménagements urbain, agriculture intensive et déprise agricole, chenalisation des réseaux hydriques, changement climatique, contribuent à l’assèchement des zones humides dans lesquelles vit l’orchidée. Un Plan National d’Actions en faveur du Liparis de Loesel a été mis en place sur la période 2010-2014. Le PNA se déploie sur trois grands axes : la connaissance, la conservation et la sensibilisation. La présente évaluation a pour objectifs d’analyser l'effet du PNA sur la conservation de l'espèce, de définir des pistes sur les suites à donner au plan et d’apporter des recommandations sur la stratégie de conservation à mener dans l’avenir. L’évaluation, après analyse du bilan technico-financier et du jeu d’acteurs, s’est attachée à évaluer l’efficacité des actions du PNA. Sur la période du PNA, 78% des actions ont été mises en oeuvre ou initiées. Ces actions ont permis d’améliorer les connaissances sur l’espèce, de structurer et de consolider le réseau d’acteurs, d’optimiser la gestion des stations, et de structurer les stratégies régionales. L’espèce semble désormais s’être stabilisée là où elle a survécu à l’urbanisation (dans la partie nord du littoral atlantique et des Alpes). La population nationale demeure plus menacée, dans les régions où les stations sont plus isolées et clairsemées (Poitou-Charentes, Corse, Lorraine, Champagne-Ardenne), mais aussi là où les populations ont de faibles effectifs toutes régions confondues. Seul le maintien des actions en cours et la continuité de leur financement permettra de pérenniser cet état dans le temps. Des actions de conservation, dans la durée, ciblant la restauration des habitats de l’espèce pourraient convenir pour une gestion sur le long terme des populations de Liparis, avec un financement significatif. Le renfort de la recherche sur la conservation in et ex situ ainsi que la consolidation de la synergie avec d’autres programmes de conservation, comme le programme LIFE ‘tourbières’ et les contrats Natura2000, pourront également bénéficier au Liparis de Loesel.
L'UMS Patrimoine naturel-PatriNat Centre d'expertise et de données sur la nature Depuis janvier 2... more L'UMS Patrimoine naturel-PatriNat Centre d'expertise et de données sur la nature Depuis janvier 2017, l'Unité Mixte de Service 2006 Patrimoine naturel assure des missions d'expertise et de gestion des connaissances pour ses trois tutelles, que sont le Muséum national d'Histoire naturelle, l'Agence française pour la biodiversité et le CNRS. Son objectif est de fournir une expertise fondée sur la collecte et l'analyse de données de la biodiversité et de la géodiversité, et sur la maitrise et l'apport de nouvelles connaissances en écologie, sciences de l'évolution et anthropologie. Cette expertise, fondée sur une approche scientifique, doit contribuer à faire émerger les questions et à proposer les réponses permettant d'améliorer les politiques publiques portant sur la biodiversité, la géodiversité et leurs relations avec les sociétés et les humains. En savoir plus : patrinat.fr Directeur : Jean-Philippe SIBLET Directeur adjoint en charge du centre de données : Laurent PONCET Directeur adjoint en charge des rapportages et de la valorisation : Julien TOUROULT Inventaire National du Patrimoine Naturel Porté par l'UMS Patrimoine naturel, cet inventaire est l'aboutissement d'une démarche qui associe scientifiques, collectivités territoriales, naturalistes et associations de protection de la nature en vue d'établir une synthèse sur le patrimoine naturel en France. Les données fournies par les partenaires sont organisées, gérées, validées et diffusées par le MNHN. Ce système est un dispositif clé du SINP et de l'Observatoire National de la Biodiversité. Afin de gérer cette importante source d'informations, le Muséum a construit une base de données permettant d'unifier les données à l'aide de référentiels taxonomiques, géographiques et administratifs. Il est ainsi possible d'accéder à des listes d'espèces par commune, par espace protégé ou par maille de 10x10 km. Grâce à ces systèmes de référence, il est possible de produire des synthèses, quelle que soit la source d'information. Ce système d'information permet de consolider des informations qui étaient jusqu'à présent dispersées. Il concerne la métropole et l'outre-mer, aussi bien la partie terrestre que marine. C'est une contribution majeure pour la connaissance naturaliste, l'expertise, la recherche en macroécologie et l'élaboration de stratégies de conservation efficaces du patrimoine naturel.
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